MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 66980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002953	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002953	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002953	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002953	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002953	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002953	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002953	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002953	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002953	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002953	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
12	NC_002953	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
13	NC_002953	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
14	NC_002953	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
15	NC_002953	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
16	NC_002953	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
17	NC_002953	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
18	NC_002953	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
19	NC_002953	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	49484913
20	NC_002953	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484913
21	NC_002953	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
22	NC_002953	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	49484913
23	NC_002953	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	49484913
24	NC_002953	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
25	NC_002953	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
26	NC_002953	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
27	NC_002953	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
28	NC_002953	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484913
29	NC_002953	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
30	NC_002953	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
31	NC_002953	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
32	NC_002953	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
33	NC_002953	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
34	NC_002953	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
35	NC_002953	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
36	NC_002953	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
37	NC_002953	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	49484913
38	NC_002953	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	49484913
39	NC_002953	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
40	NC_002953	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484913
41	NC_002953	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
42	NC_002953	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
43	NC_002953	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	49484913
44	NC_002953	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
45	NC_002953	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484913
46	NC_002953	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	49484913
47	NC_002953	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
48	NC_002953	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
49	NC_002953	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
50	NC_002953	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002953	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002953	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_002953	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_002953	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002953	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002953	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002953	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
58	NC_002953	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
59	NC_002953	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
60	NC_002953	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
61	NC_002953	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
62	NC_002953	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
63	NC_002953	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	49484914
64	NC_002953	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
65	NC_002953	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	49484914
66	NC_002953	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
67	NC_002953	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	49484914
68	NC_002953	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	49484914
69	NC_002953	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	49484914
70	NC_002953	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
71	NC_002953	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484914
72	NC_002953	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	49484914
73	NC_002953	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
74	NC_002953	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
75	NC_002953	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	49484914
76	NC_002953	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
77	NC_002953	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
78	NC_002953	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	49484914
79	NC_002953	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
80	NC_002953	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
81	NC_002953	AAC	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
82	NC_002953	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
83	NC_002953	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
84	NC_002953	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
85	NC_002953	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
86	NC_002953	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
87	NC_002953	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
88	NC_002953	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	49484914
89	NC_002953	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
90	NC_002953	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	49484914
91	NC_002953	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
92	NC_002953	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
93	NC_002953	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
94	NC_002953	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484914
95	NC_002953	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
96	NC_002953	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002953	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_002953	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002953	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002953	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002953	AT	3	6	3433	3438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002953	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002953	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002953	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002953	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002953	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002953	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002953	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002953	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
110	NC_002953	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484915
111	NC_002953	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484915
112	NC_002953	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
113	NC_002953	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484915
114	NC_002953	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	49484915
115	NC_002953	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	49484915
116	NC_002953	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	49484915
117	NC_002953	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
118	NC_002953	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	49484916
119	NC_002953	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
120	NC_002953	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	49484916
121	NC_002953	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
122	NC_002953	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49484916
123	NC_002953	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
124	NC_002953	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
125	NC_002953	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
126	NC_002953	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	49484916
127	NC_002953	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
128	NC_002953	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
129	NC_002953	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
130	NC_002953	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
131	NC_002953	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
132	NC_002953	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
133	NC_002953	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
134	NC_002953	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
135	NC_002953	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
136	NC_002953	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484917
137	NC_002953	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	49484917
138	NC_002953	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	49484917
139	NC_002953	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484917
140	NC_002953	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	49484917
141	NC_002953	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
142	NC_002953	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	49484917
143	NC_002953	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
144	NC_002953	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	49484917
145	NC_002953	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
146	NC_002953	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
147	NC_002953	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	49484917
148	NC_002953	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
149	NC_002953	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	49484917
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153	NC_002953	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
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155	NC_002953	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
156	NC_002953	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
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159	NC_002953	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
160	NC_002953	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	49484917
161	NC_002953	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
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169	NC_002953	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	49484917
170	NC_002953	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	49484917
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172	NC_002953	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484917
173	NC_002953	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
174	NC_002953	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	49484917
175	NC_002953	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	49484917
176	NC_002953	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484917
177	NC_002953	TGT	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
178	NC_002953	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
179	NC_002953	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
180	NC_002953	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_002953	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	49484918
182	NC_002953	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484918
183	NC_002953	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	49484918
184	NC_002953	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49484918
185	NC_002953	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
186	NC_002953	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	49484918
187	NC_002953	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484918
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191	NC_002953	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	49484918
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256	NC_002953	TGG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484919
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272	NC_002953	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_002953	TAT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_002953	ATT	3	9	10666	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_002953	ACA	2	6	10748	10753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_002953	ATA	2	6	10791	10796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_002953	AAG	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_002953	AGG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
407	NC_002953	A	6	6	16100	16105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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